SMA Negeri 2 Amfoang Timur berdiri pada tahun 2010. Pada saat berdiri sekolah ini masi filial dan menumpang di SMP Negeri 2 Amfoang Utaran kemudian Pindah ke SD Negeri Nunuanah sampai dengan dibangunnya Ruang Kelas SMA Negeri 2 Amfoang Timur yang berlokasi di Jl. Vetor Kameo - Desa Nunuanah pada tahun 2017. 

Berikut ini Daftar Kepala SMA Negeri 2 Amfoang Timur dari awal berdirinya sekolah hingga saat ini:

1. Fransciscus X. A. Asi, S.Pd
2. Eni Adriana Neppa Rasi, S.Pd

SMA Negeri 2 Amfoang Timur selalu berbenah dalam memberikan pelayanan pendidikan kepada masyarakat dengan membangun sarana-prasarana demi mewujudkan tujuaan pendidikan Indonesia. Berikut ini fasilitas yang dimiliki oleh  SMA Negeri 2 Amfoang Timur, yaitu :

1. Ruang Kelas

2. Ruang Kepala Sekolah

3. Ruang Guru

4. Perpusatakaan

5. Lab Komputer

6. Toilet Guru dan Siswa

7. Gudang

Selain itu untuk menunjang proses Kegiatan Belajar Mengajar (KBM), SMA Negeri 2 Amfoang Timur telah mempergunakan media pembelajaran berbasis IT disetiap ruang kelas. Juga fasilitas jaringan wifi yang cukup memadai. Semua itu diupayakan oleh semua stakeholder sekolah secara khusus untuk mewujudkan Visi dan Misi yang diemban sekolah, serta tercapainya tujuan pendidikan nasional pada umumnya.